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Detection of respiratory syncytial virus based on RT-RPA and CRISPR-Cas12a

2025-05-19
조회수 84

RT-RPA와 CRISPR/Cas12a를 이용한 호흡기 세포융합 바이러스 (RSV) A형 및 B형 검출법 개발

이 연구는 전 세계적으로 영유아에게 가장 흔하게 감염되는 바이러스 중 하나인 **인간 호흡기 세포융합 바이러스 (hRSV)**를 효과적으로 검출하고 구분하는 새로운 방법에 대한 것입니다. 특히, 의료 자원이 부족한 환경에서도 사용될 수 있는 진단법 개발에 초점을 맞추었습니다.

연구 방법 및 주요 결과:

  1. 핵심 기술: 연구팀은 RT-RPA (역전사 재조합효소 중합반응) 기술과 CRISPR/Cas12a (크리스퍼 유전자 가위 기술의 일종) 검출 시스템을 결합한 새로운 진단법을 개발했습니다.

    • RT-RPA: 이 기술은 바이러스의 RNA 유전물질을 DNA로 변환(역전사)한 후, 특정 유전자 부위를 빠르고 민감하게 증폭시키는 방법입니다. 기존의 PCR 방식보다 낮은 온도에서 반응이 가능하고, 장비가 비교적 간단하여 현장 진단에 유리합니다.
    • CRISPR/Cas12a: 증폭된 유전자 산물을 Cas12a 단백질과 가이드 RNA를 이용하여 특이적으로 인식하고 절단합니다. 이 절단 과정에서 형광 신호 등을 발생시켜 바이러스 존재 유무를 시각적으로 또는 기기를 통해 확인할 수 있게 합니다. 이 기술은 높은 특이성을 제공하여 유사한 다른 바이러스와 구분하는 데 도움을 줍니다.
  2. 검출 대상: 이 방법을 이용하여 RSV-A형과 RSV-B형을 동시에 검출하고 서로 구별할 수 있도록 설계되었습니다. RSV는 크게 A형과 B형으로 나뉘며, 이 두 아형을 구분하는 것은 역학 조사나 백신 개발 등에 중요할 수 있습니다.

  3. 검출 한계 (민감도): 개발된 검사법의 민감도를 평가한 결과, 다음과 같았습니다.

    • RSV-A형: 반응액 당 약 **100개 (10^2 copies/reaction)**의 바이러스 유전자 사본까지 검출 가능했습니다.
    • RSV-B형: 반응액 당 약 **1000개 (10^3 copies/reaction)**의 바이러스 유전자 사본까지 검출 가능했습니다. 이는 매우 적은 양의 바이러스로도 감염 여부를 확인할 수 있음을 의미합니다.
  4. 특이도: 다른 호흡기 바이러스 등과 혼동하지 않고 RSV-A형과 RSV-B형만을 정확히 찾아내는 능력(특이도)은 **100%**로 나타났습니다. 이는 위양성(실제로는 없는데 있다고 판정하는 오류) 가능성이 매우 낮음을 의미합니다.

  5. 진단 정확도 (기존 방법과의 비교): 현재 표준 검사법으로 널리 사용되는 **RT-qPCR (실시간 역전사 중합효소 연쇄반응)**과 비교했을 때, 개발된 검사법의 진단 정확도는 다음과 같았습니다.

    • RSV-A형: 90.32%
    • RSV-B형: 93.55% 이는 기존의 복잡하고 고가의 장비가 필요한 RT-qPCR 방법과 비교하여 상당히 높은 수준의 정확도를 보여주는 결과입니다.

결론 및 전망:

연구팀은 이러한 결과들을 바탕으로, 개발된 RT-RPA와 CRISPR/Cas12a를 결합한 검사법이 RSV 감염을 신속하고 정확하게 선별(스크리닝)하는 데 매우 효과적인 전략이 될 수 있다고 결론지었습니다.

더 나아가, 이 기술은 RSV뿐만 아니라 다양한 다른 종류의 바이러스 감염을 검출하는 데에도 유망하게 응용될 수 있는 잠재력을 가지고 있음을 시사합니다. 특히, 현장 진단이 중요하거나 의료 인프라가 부족한 지역에서 빠르고 간편하게 바이러스 감염 여부를 확인할 수 있는 도구로서의 가치가 클 것으로 기대됩니다.