TwistAmp® RPA Kits & RPA Technology
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RH-RPA: A Rapid and Highly Sensitive Assay for Nucleic Acid Detection Based on RNase HII Combined with Recombinase Polymerase Amplification

2025-05-08
조회수 60

기존의 재조합효소 중합효소 증폭(Recombinase Polymerase Amplification, RPA) 기반 검출법의 한계를 극복하기 위해 새로 개발된 RH-RPA (RPA combined with E. coli RNase HII assay) 기술에 대한 내용입니다. 이 기술의 특징과 장점을 자세히 설명드리겠습니다.

배경:

  • 현재 RPA 및 RT-RPA (역전사 RPA) 프로브 분석법에는 주로 RPA-exo와 RPA-nfo 방식이 사용됩니다. 이들은 다양한 표적 물질(DNA, RNA 등)을 검출하는 데 널리 활용되고 있습니다.
  • 하지만 기존 방식에는 단점이 있습니다.
    • RPA-nfo: 민감도가 RPA-exo 방식에 비해 상대적으로 낮습니다.
    • RPA-exo: RPA-nfo 방식처럼 별도의 장비 없이 육안으로 결과를 확인할 수 있는 기능이 없습니다.
  • 이러한 한계점들 때문에 RPA/RT-RPA 프로브 분석법이 더 넓은 분야에 응용되는 데 제약이 있었습니다.

새로 개발된 RH-RPA 기술:

  • 연구팀은 이러한 문제점을 해결하기 위해 대장균( E. coli)의 RNase HII 효소를 RPA 기술과 결합한 RH-RPA라는 새로운 방법을 개발했습니다.
  • 주요 특징 및 장점:
    1. 두 가지 검출 방식 지원:
      • 형광 신호 검출: 정밀한 분석이 가능합니다.
      • 측방 유동 스트립(Lateral-flow strip) 판독: 간단한 스트립을 이용해 육안으로 결과를 확인할 수 있어 장비가 없는 환경에서도 사용 가능합니다.
    2. 높은 효율성과 특이성: 대장균 RNase HII 효소는 표적 물질을 매우 효율적이고 특이적으로 인식하여 절단합니다. 이 덕분에 RH-RPA는 신속하고 정확한 분자 진단 플랫폼으로 기능할 수 있습니다.
    3. 우수한 민감도와 신속성:
      • 형광 검출 방식: DNA와 RNA 모두에 대해 반응당 10개 복제본(copies)까지 20분 이내에 검출할 수 있습니다.
      • 측방 유동 스트립 방식: 핵산을 반응당 5개 복제본까지 20분 이내에 검출할 수 있어 민감도가 더 높습니다.
    4. 임상적 유효성 확인:
      • A형 인플루엔자 바이러스 검출을 위한 임상 샘플 분석에서 RT RH-RPA (역전사 RH-RPA) 방법은 100%의 정확도를 보여 실제 진단 환경에서의 높은 신뢰성을 입증했습니다.
    5. 종합적 우수성:
      • 안정적인 특이성, 빠른 검출 속도, 높은 민감도, 비용 효율성을 갖추고 있습니다.

결론 및 기대효과:

  • RH-RPA 방법은 기존 RPA 기술의 단점들을 보완하여, 안정적이고 신속하며 민감도가 높고 비용 효율적인 핵산 검출 방법입니다.
  • 특히 현장 진단(Point-of-care testing, POCT)과 같이 신속하고 간편한 검사가 필요한 환경에서 유용하게 사용될 수 있는 잠재력을 가진 기술로 평가됩니다.

요약하자면, 이 연구는 대장균 RNase HII 효소를 활용하여 형광 검출과 육안 확인이 모두 가능하면서도 민감도와 신속성을 크게 향상시킨 새로운 RPA 기반 핵산 검출법(RH-RPA)을 개발하였고, 실제 바이러스 검출에서도 그 우수성을 입증했다는 내용입니다.